13〜16世紀（中世）の時代は，武将たちが領地を広げるために，戦いの日々が続きました。特に白石館の周辺は，佐竹氏と江戸氏の領地争いによってたびたび戦場となりました。白石館には，守りを固めるために一辺が165ｍの方形に大堀がめぐらされ，複雑な堀や土塁（どるい），柵などが設けられていました。館主の入れ替わりも激しく，特定の館主を推定することはできませんが，1589年に佐竹氏が江戸氏を水戸城から追い出してからは，白石館の役目も終わり，廃城となったものと思われます。その後は，墓地として使用されたようです。